庫房在消毒粉刷前，應將庫內食品全部撤出，并清除地坪、墻和頂板上的污穢，發現有霉菌的地方，應仔細用刮刀或刷子清除。在低溫庫內，要清除墻頂和排管上的冰霜。必要時需將庫溫升至正溫。

    庫房內刷白，1m3消毒表面所消耗的混合劑約為300mL，在正溫庫房可用排筆涂刷，負溫時可用細噴漿器噴灑，有時會出現一層薄溶液凍結層，經1-3d以后，表面會逐步變干。

    冷庫內消毒的效果根據霉菌抱子的減少來評定。因此，在消毒前后均要作測定和記錄。消毒后，每平方厘米表面上不得多于一個霉菌孢子。