蒸發式冷凝器的控制特點是:可以根據冷凝壓力確定冷凝風扇的開啟數量以及水泵的運行數量;在北方地區冬季對于沒有設置油泵的螺桿壓縮機設置恒壓起動，以及冷凝風扇的變頻運行。

對于一些控制回路，控制要求并不是太多，局部也有使用繼電器控制的。而對于自帶控制面板的設備，例如自動放空氣器，直接給這些設備提供電源即可。

對于一些制冷系統不是很大，系統控制比較簡單的，可以直接使用固定控制線路的控制模塊(例如小精靈的控制模塊)，在使用這些模塊時可以根據使用的需要，簡單地編制輸入一些應用的數據。例如需要控制的各個冷間的溫度，冷風機融霜的時間，融霜的結束溫度，甚至是融霜結束后冷風機風扇的延時開始時間等。

一些更加先進的設計已經采用以太網，對制冷系統進行控制和數據采染與傳送，網絡控制將是今后控制的發展方向。這種控制方式可以通過網絡遠程對系統的控制程序進行修改和側試，在這些網絡監控中，用戶和設計安裝單位根據不同的崗位有不同級別的使用密碼，不同等級的使用密碼可以進入這個系統不同的控制層面，最高級別的密碼可以對整個控制系統任意進行修改。為了防止隨意對系統的修改造成系統的控制程序紊亂，以防止網絡黑客的入侵，這種系統的設置除了嚴格控制對密碼的管理外，還要設置嚴密的網絡安全保護措施，防止對系統的破壞和商業勒索事件的發生。